Trong 26 lần tổ chức từ 1995 đến 2021 thì có 21 lần tổ chức tại trường Trung học phổ thông chuyên Lê Hồng Phong, Thành phố Hồ Chí Minh, 1 lần tại trường Quốc học Huế năm 2007, 2 lần tại trường THPT chuyên Lê Quý Đôn, Đà Nẵng vào năm 1999 và 2006, 1 lần tại trường Trung học phổ thông chuyên Lý Tự Trọng, Cần Thơ năm 2011, 1 lần tại trường Trung học phổ thông Chuyên Lê Quý Đôn, Vũng Tàu năm 2012.

Kỳ thi lần thứ 19 tới 26 đều tổ chức tại trường THPT chuyên Lê Hồng Phong.

Kỳ thi lần thứ 26 là một kì thi đặc biệt, diễn ra trong vòng 2 năm. Dưới ảnh hưởng của đại dịch COVID-19, cuộc thi lần thứ 26 (năm 2020) đã bị hủy để đảm bảo an toàn phòng dịch và được dời sang tổ chức vào năm 2021. Như vậy 27 năm từ khi bắt đầu tổ chức, có 1 năm cuộc thi không được diễn ra. Các học sinh thuộc khoá sinh năm 2003 và 2004 cũng là 2 khoá đặc biệt khi chỉ có tối đa 1 cơ hội được tham dự cuộc thi.